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Le plus grand institut de génomique au monde annonce un service abordable de séquençage de l'ADN accéléré par les GPU NVIDIA basé sur le Cloud

Le service EasyGenomics de BGI ouvre une nouvelle ère où la médecine personnalisée à prix abordable devient presque une réalité

NVIDIA Corporation:   
Stéphane Quentin
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OXYGEN
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Bio-IT World 2012, Boston - 26 avril 2012 - NVIDIA annonce aujourd'hui que BGI , le plus grand institut de génomique au monde, va lancer un service dans le Cloud qui permettra aux chercheurs du monde entier d'effectuer, à prix abordable, des analyses bio-informatiques de séquençage de prochaine génération (NGS).

Le nouveau service "EasyGenomics" de BGI localisé à Shenzhen, en Chine, associe une interface utilisateur intuitive avec des analyses de pipeline automatisées ainsi que des logiciels et des outils de BGI. Ces derniers sont intégrés à la plus grande plateforme de séquençage de l'industrie afin de fournir aux biologistes, bio-informaticiens, voir même aux médecins, la possibilité de soumettre et de recevoir une analyse automatisée des données de séquençage de l'ADN.

Accéléré par les GPU NVIDIA, ce qui réduit le temps de traitement de l'analyse de l’ADN - qui représente de gros volumes de données - le faisant passer de plusieurs jours à seulement quelques heures par rapport à un système basé sur CPU, l'EasyGenomics élargit considérablement les capacités de la recherche en génomique de pointe : ces dernières seront accessibles aux chercheurs du monde entier, et cette avancée scientifique débouchera sur une nouvelle ère d’une médecine personnalisée abordable et viable.

BGI va lancer une version d'essai gratuite et limitée de ce nouveau service destinée aux biologistes et aux bio-informaticiens qualifiés lors de la conférence et de l'exposition mondiale Bio-IT 2012. Pour en savoir plus ou pour s'inscrire, rendez-vous sur le site web de EasyGenomics .

“En permettant à un plus grand nombre de chercheurs d'accélérer les données de séquençage de l'ADN plus facilement et à moindre coût, nous espérons faciliter l'utilisation de la génomique dans les diagnostics cliniques aussi bien comme composante pratique des soins de santé, que pour la recherche des maladies complexes," déclare le Docteur Lin Fang, vice-président de BGI. "L'accélération GPU permet aux scientifiques d'analyser les données de séquençage de l'ADN plus vite qu'auparavant, en réduisant la durée du traitement, de cinq jours à presque cinq heures. Une fois déployée pleinement dans le Cloud, nous nous attendons à ce que EasyGenomics puisse un jour, révolutionner la recherche en génomique. "

Le service Cloud EasyGenomics exploite des systèmes informatiques hybrides boostés par les GPU Tesla M2070 et M2075® de NVIDIA®, ce qui accélère l'analyse de données du séquençage de l'ADN en conjonction avec les processeurs du système. BGI prévoit de mettre à niveau le service EasyGenomics en lui adjoignant des centaines de GPU NVIDIA Tesla lorsqu’il sera entièrement déployé et que, selon les prévisions, il prendra en charge des milliers d'utilisateurs.

"Cela pourrait être l'année du génome à 1000 $ grâce à la baisse rapide des coûts du séquençage. Nous allons bientôt être noyés dans un déluge de données venant des séquenceurs de génome", souligne Sumit Gupta, directeur de la division Tesla chez NVIDIA. "Le service EasyGenomics de BGI utilise la puissance du calcul GPU afin de fournir une méthode abordable et facile à utiliser aux scientifiques pour régler ce nouveau problème des gros volumes de données génomiques, et ce, dans le but de nous apporter davantage de traitements individualisés efficaces et à moindre coût."

BGI réalise des travaux révolutionnaires dans le séquençage génomique d'un large éventail d’éléments vivants - allant des plantes à la bactérie E. coli, en passant par le panda géant – afin de développer de meilleurs médicaments et des aliments améliorés génétiquement, ainsi que pour perfectionner les soins de santé. Basé à Shenzhen, en Chine, avec des filiales à Cambridge, Massachusetts, et à Copenhague au Danemark, BGI vise à rendre la science génomique de pointe très accessible. Pour plus d'informations sur BGI, allez sur http://www.genomics.cn/en.

À propos des GPU Tesla de NVIDIA
Les GPU Tesla de NVIDIA sont des accélérateurs massivement parallèles basées sur la plate-forme de calcul parallèle CUDA ® de NVIDIA. Conçus entièrement pour le calcul haute performance (HPC), l'informatique et le supercalcul, ces processeurs graphiques Tesla délivrent significativement plus de performance par rapport aux CPU seuls pour un large éventail d'applications scientifiques et commerciales. Aujourd'hui, les GPU Tesla animent trois des cinq meilleurs supercalculateurs au monde.

Pour plus d'informations sur les GPU Tesla de NVIDIA, allez sur le site Web de Tesla. Pour en savoir plus sur CUDA ou télécharger la dernière version en date, visitez le site Web de CUDA. Pour plus de nouveautés NVIDIA, d'information sur la société et ses produits ou encore de vidéos /images, rendez-vous sur le newsroom NVIDIA . Vous pouvez également nous suivre sur Twitter (@ NVIDIATesla).

À propos de NVIDIA
NVIDIA (NASDAQ : NVDA) a révolutionné le monde de l’informatique en inventant le processeur graphique (GPU) en 1999. Aujourd’hui, les nouveaux processeurs NVIDIA boostent une grande gamme de produits allant des smartphones aux supercalculateurs. Les processeurs mobiles de NVIDIA équipent les téléphones portables, les tablettes et les systèmes automobiles d'information/divertissement. Les joueurs PC profitent des GPU NVIDIA pour vivre une expérience époustouflante et immersive. Les professionnels les utilisent - entre autres - pour créer des effets spéciaux pour l’industrie du cinéma et pour concevoir des produits allant des clubs de golf aux avions de ligne. Quant aux chercheurs, ils exploitent la puissance des GPU pour repousser les frontières de la science avec le calcul haute performance. NVIDIA détient actuellement plus de 4500 brevets d’invention, qui ont donné naissance à des évolutions incontournables de l’informatique moderne. Pour plus d’informations, rendez-voussur www.nvidia.fr.

Certaines déclarations contenues dans ce communiqué de presse, y compris, mais non limité à des déclarations comme: l’impact et les avantages des GPU Tesla de NVIDIA ; les effets des brevets de la société sur l'informatique moderne sont des énoncés prospectifs qui sont assujettis à risques et incertitudes qui pourraient entraîner des résultats sensiblement différents que les attentes. Les éléments importants qui pourraient donner lieu des résultats réels différents sont : la conjoncture économique mondiale, notre dépendance envers des tiers à fabriquer, assembler, conditionner et tester nos produits; l'impact du développement technologique et de la concurrence, le développement de nouveaux produits et de nouvelles technologies ou les améliorations de nos produits et de nos technologies; la confiance du marché pour nos propres produits ou pour ceux de nos partenaires; la conception, les défauts de fabrication ou de logiciels, les changements dans les préférences ou les attentes des consommateurs, les changements de normes de l'industrie et des interfaces, la perte inattendue de performance de nos produits ou technologies une fois intégrés dans les systèmes, ainsi que d'autres facteurs détaillés de temps à autre dans les rapports que NVIDIA dépose auprès de la Securities and Exchange Commission, ou SEC, y compris son formulaire 10-K pour l'exercice financier terminé le 29 janvier 2012. Des copies des rapports déposés auprès de la SEC sont affichées sur le site Web de la société et sont disponibles auprès de NVIDIA sans frais. Ces énoncés prospectifs ne sont pas des garanties de performances futures et ne sont valables qu'à la date des présents et, sauf si la loi l'exige, NVIDIA décline toute obligation d'actualiser ces énoncés prospectifs pour refléter des événements ou circonstances futurs.

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